pitakonbg

Genetika populasi genom lan pemantauan molekuler resistensi insektisida ing nyamuk Anopheles ing Sebatkilo, Awash, Ethiopia

Wiwit ditemokaké ing Djibouti taun 2012, nyamuk Anopheles stephensi Asia wis nyebar ing saindhenging Tanduk Afrika. Vektor invasif iki terus nyebar ing saindenging bawana, nyebabake ancaman serius kanggo program kontrol malaria. Cara kontrol vektor, kalebu kelambu sing diobati karo insektisida lan nyemprot sisa ing njero ruangan, wis nyuda beban malaria kanthi signifikan. Nanging, tambah akeh nyamuk tahan insektisida, kalebu populasi Anopheles stephensi, ngalangi upaya ngilangi malaria. Ngerteni struktur populasi, aliran gen antarane populasi, lan distribusi mutasi resistensi insektisida penting kanggo nuntun strategi kontrol malaria sing efektif.
Ngapikake pemahaman kita babagan carane An. stephensi dadi mapan ing HOA iku penting kanggo prédhiksi potensial nyebar menyang wilayah anyar. Genetika populasi wis digunakake sacara ekstensif kanggo nyinaoni spesies vektor kanggo ngerteni struktur populasi, pilihan sing terus-terusan, lan aliran gen18,19. Kanggo An. stephensi, nyinaoni struktur populasi lan struktur génom bisa mbantu njlentrehake rute invasi lan évolusi adaptif sing bisa kedadeyan wiwit munculé. Saliyane aliran gen, seleksi penting banget amarga bisa ngenali alel sing ana gandhengane karo resistensi insektisida lan menehi katrangan babagan cara alel kasebut nyebar ing populasi20.
Nganti saiki, uji coba penanda tahan insektisida lan genetika populasi ing spesies invasif Anopheles stephensi wis diwatesi mung sawetara gen calon. Munculé spesies ing Afrika ora dimangertèni kanthi lengkap, nanging siji hipotesis yaiku sing dikenalaké déning manungsa utawa kéwan. Teori liyane kalebu migrasi jarak adoh dening angin. Isolat Ethiopia sing digunakake ing panliten iki diklumpukake ing Awash Sebat Kilo, sawijining kutha sing dumunung 200 km sisih wétan Addis Ababa lan ing koridor transportasi utama saka Addis Ababa menyang Djibouti. Awash Sebat Kilo minangka tlatah kanthi transmisi malaria dhuwur lan akeh populasi Anopheles stephensi, sing dilapurake tahan kanggo insektisida, dadi situs penting kanggo nyinaoni genetika populasi Anopheles stephensi8.
Mutasi resistensi insektisida kdr L1014F dideteksi kanthi frekuensi rendah ing populasi Ethiopia lan ora dideteksi ing conto lapangan India. Mutasi kdr iki menehi resistensi marang piretroid lan DDT lan sadurunge dideteksi ing An. Populasi stephensi sing diklumpukake ing India ing 2016 lan Afghanistan ing 2018.31,32 Senadyan bukti resistensi pyrethroid nyebar ing loro kutha kasebut, mutasi kdr L1014F ora dideteksi ing populasi Mangalore lan Bangalore sing dianalisis ing kene. Proporsi sing kurang saka isolat Ethiopia sing nggawa SNP iki heterozigot nuduhake yen mutasi muncul bubar ing populasi iki. Iki didhukung dening panaliten sadurunge ing Awash sing ora nemokake bukti mutasi kdr ing conto sing diklumpukake ing taun sadurunge sing dianalisis ing kene.18 Kita sadurunge ngidhentifikasi mutasi kdr L1014F iki kanthi frekuensi rendah ing sakumpulan conto saka wilayah / taun sing padha nggunakake pendekatan deteksi amplikon. modifikasi tanggung jawab kanggo phenotype diamati iki.
Watesan panliten iki yaiku ora ana data fenotipik babagan respon insektisida. Panaliten luwih lanjut sing nggabungake urutan genom wutuh (WGS) utawa urutan amplikon sing ditargetake kanthi kombinasi bioassay kerentanan dibutuhake kanggo neliti pengaruh mutasi kasebut ing respon insektisida. SNP missense novel iki sing bisa digandhengake karo resistensi kudu ditargetake kanggo tes molekuler throughput dhuwur kanggo ndhukung pemantauan lan nggampangake karya fungsional kanggo mangerteni lan ngesyahke mekanisme potensial sing ana gandhengane karo fenotipe resistensi.
Ringkesan, panliten iki menehi pangerten sing luwih jero babagan genetika populasi nyamuk Anopheles ing saindenging bawana. Aplikasi analisis urutan genom wutuh (WGS) menyang kohort sampel sing luwih gedhe ing wilayah geografis sing beda-beda bakal dadi kunci kanggo mangerteni aliran gen lan ngenali tandha tahan insektisida. Kawruh iki bakal ngidini panguwasa kesehatan masyarakat nggawe pilihan sing tepat babagan pengawasan vektor lan panggunaan insektisida.
Kita nggunakake rong pendekatan kanggo ndeteksi variasi nomer salinan ing dataset iki. Kaping pisanan, kita nggunakake pendekatan basis jangkoan sing fokus ing klompok gen CYP sing diidentifikasi ing genom (Tabel Tambahan S5). Jangkoan sampel dirata-rata ing lokasi koleksi lan dipérang dadi patang klompok: Ethiopia, lapangan India, koloni India, lan koloni Pakistan. Cakupan kanggo saben klompok dinormalisasi nggunakake kernel smoothing lan banjur diplot miturut ambane jangkoan genom median kanggo klompok kasebut.


Wektu kirim: Jun-23-2025